Endo, que ha sufrido una temporada marcada por las lesiones en el Liverpool, ha sido reemplazado por el delantero del Borussia Monchengladbach Shuto Machino, según informó la Asociación Japonesa de Fútbol en un comunicado.
"Desde que me lesioné, he hecho todo lo posible hasta ahora, así que no tengo ningún remordimiento", afirmó Endo en una publicación en redes sociales.
El jugador, de 33 años, reconoció su frustración por no poder participar en el gran torneo, pero se mostró orgulloso del crecimiento del equipo desde el Mundial 2022 en Catar.
"Con esta convocatoria, me retiro de la selección. A partir de ahora, animaré a la selección japonesa como un aficionado más", añadió.
Japón está en el Grupo F y debutará en su octava participación en la fase final del Mundial ante Países Bajos en Dallas el 14 de junio, antes de enfrentarse a Túnez y Suecia.