El 14 de noviembre de 2009, España – Argentina 2-1
Gol de Messi con la selección: 13.º
En el banquillo local estaba Vicente del Bosque, mientras que su homólogo era Diego Maradona. El duelo de gigantes, disputado en el estadio del Atlético de Madrid durante la celebración del centenario de la Federación Española de Fútbol, lo resolvió mejor el primero. Sus jugadores, que en ese momento eran los campeones de Europa, arrasaban a sus rivales en otoño. Esta fue su octava victoria consecutiva y, ocho meses después, confirmaron su dominio en Sudáfrica al conquistar el título mundial.
Frente a Lionel Messi estaban cinco de sus entonces compañeros del Barcelona, que lograron casi borrarlo del partido. Solo pudo marcar desde el punto de penalti, respondiendo a la diana de Xabi Alonso al inicio del encuentro y arruinando la portería a cero de Iker Casillas en su partido número cien con la selección. La última palabra la tuvo Xabi Alonso, que marcó su segundo gol del partido también de penalti, y el eterno inconformista Maradona opinó que el empate habría sido más justo.
El 7 de septiembre de 2010, Argentina – España 4-1
Gol de Messi con la selección: 14.º
Los flamantes campeones del mundo viajaron a Buenos Aires para un amistoso y recibieron un duro golpe. Del Bosque, pocos días después de un partido de clasificación para la Eurocopa, dio descanso a su cerebro Xavi y al portero Casillas, y su sustituto Pepe Reina ya había recogido el balón de su portería por tercera vez en media hora tras resbalarse. España no tuvo su día, estrelló tres balones en los palos y acabó sufriendo apenas su tercera derrota desde 2006, periodo en el que había disputado 58 partidos.
Messi, que atravesaba una etapa complicada con la selección y no había marcado en casi un año desde el último partido ante España, incluyendo el Mundial 2010, vio puerta a los 10 minutos. El técnico de los derrotados achacó el resultado al dominio rival en el centro del campo, donde, según él, su equipo fue superado en número y perdió la posesión. Tres de los cuatro goles de los ganadores fueron obra de jugadores que militaban en los mejores clubes españoles: Messi (Barcelona), Higuaín (Real Madrid) y Agüero (Atlético).
El 27 de marzo de 2018, España – Argentina 6-1
Tiros a puerta: 6-3.
Una de las tres derrotas más duras en la historia de la selección argentina. Por el mismo marcador, la albiceleste fue humillada por Checoslovaquia en el Mundial de 1958 y por Bolivia en la clasificación para el Mundial 2010. La albiceleste jugó sin Messi, que no pudo estar en el campo por una lesión muscular. Su mayor estrella sufrió en la grada del estadio del Atlético de Madrid, contando los goles que recibían sus compañeros.
Tres de los goles fueron obra de un hat-trick de Isco, aunque quizá el mayor mérito en la contundente victoria fue para el suplente Iago Aspas. El delantero del Celta participó en tres goles en solo una parte (1+2). Su único tanto llegó tras un pase largo del portero David de Gea. Tras el partido, Messi bajó al vestuario para consolar a sus compañeros abatidos, mientras que el delantero español Diego Costa, autor del primer gol, criticó a los aficionados y medios argentinos. "Les encanta criticar a Messi. Ahora ven lo que son sin él," afirmó.